From cc7fd6c72bd81bd5cb21621d106eedeb034958dd Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: KaHea-21 Date: Fri, 7 Feb 2025 09:54:24 +0000 Subject: [PATCH 1/3] C14Keller2019 --- ...cientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv | 30 +++++++++++++++++++ 1 file changed, 30 insertions(+) diff --git a/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv b/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv index 172d6e3d0..f55b9334b 100644 --- a/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv +++ b/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv @@ -3,3 +3,33 @@ AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 1343UnTal85 PRJEB19335 ERS18 AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 6Post PRJEB19335 ERS1892066 TRUE TRUE DNE FALSE main text 2 10.1371/journal.pone.0139705 TRUE MAMS 18955 AMS NR NR tooth 3574 19 -20.7 49 -99999 3.3 TRUE IntCal13 OxCal v4.2.24 default 10.1017/S0033822200033865 3957 3832 3873 cal BP 2 TRUE FALSE DNE NA NA NA NA Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT5 PRJEB24296 ERS2106903 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29430 NR NR NR tooth 3517 27 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3868 3704 3789 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT6 PRJEB24296 ERS2106904 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29431 NR NR NR tooth 3499 25 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3842 3696 -99999 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT003.B PRJEB29991 ERS3465379 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34551 . . . bone 1533 25 -31.2 . . . NA DNE DNE DNE . . 428 595 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT004 merged PRJEB29991 ERS3465380,ERS3465381 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI001.A PRJEB29991 ERS3465382 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 MAMS-38612 . . . bone 1497 24 -28.7 . . . NA DNE DNE DNE . . 474 637 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI003.A PRJEB29991 ERS3465383 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI004.A PRJEB29991 ERS3465384 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI005.A PRJEB29991 ERS3465385 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD001.A PRJEB29991 ERS3465386 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD002.A PRJEB29991 ERS3465387 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD007.A PRJEB29991 ERS3465388 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD013.A PRJEB29991 ERS3465389 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD019.A PRJEB29991 ERS3465390 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD020.A PRJEB29991 ERS3465391 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD021.A PRJEB29991 ERS3465392 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD022.A PRJEB29991 ERS3465393 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD023.A PRJEB29991 ERS3465394 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD024.A PRJEB29991 ERS3465395 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD026.A PRJEB29991 ERS3465396 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC001 merged PRJEB29991 ERS3465397,ERS3465398 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34561 . . . bone 1492 23 -13.1 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 539 632 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC005 merged PRJEB29991 ERS3465399,ERS3465400,ERS3465401 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34554 . . . bone 1505 24 -24.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 618 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC006.A PRJEB29991 ERS3465402 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34565 . . . bone 1505 24 -17.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 543 635 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET004.A PRJEB29991 ERS3465404 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31028 . . . bone 1517 17 -22.3 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 600 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET005.A PRJEB29991 ERS3465405 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31033 . . . bone 1487 21 -23.8 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 542 630 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET006.A PRJEB29991 ERS3465406 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31034 . . . bone 1551 20 -19.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 427 558 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT002.A PRJEB29991 ERS3465407 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31035 . . . bone 1555 20 -19 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 427 553 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT003.A PRJEB29991 ERS3465408 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31029 . . . bone 1520 17 -21.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 433 599 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT004.A PRJEB29991 ERS3465409 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31036 . . . bone 1587 20 -20.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 419 537 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT005.A PRJEB29991 ERS3465410 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34558 . . . bone 1505 24 -24.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 618 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT006.A PRJEB29991 ERS3465411 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31037 . . . bone 1507 20 -22.7 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 437 611 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 VAL001.B PRJEB29991 ERS3465403 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-29429 . . . tooth 1512 22 -18.2 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 432 610 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 WAG001.A PRJEB29991 ERS3465412 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31030 . . . bone 1547 16 -15.7 . . . TRUE IntCal13 CALIB NR . . 427 563 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . From 53fe4679117e69a27364eff793b97a873e9caa71 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: marcel-keller <61977721+marcel-keller@users.noreply.github.com> Date: Fri, 7 Feb 2025 14:59:56 +0100 Subject: [PATCH 2/3] Update ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv --- ...cientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv | 60 +++++++++---------- 1 file changed, 30 insertions(+), 30 deletions(-) diff --git a/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv b/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv index f55b9334b..ecf50f292 100644 --- a/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv +++ b/ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv @@ -3,33 +3,33 @@ AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 1343UnTal85 PRJEB19335 ERS18 AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 6Post PRJEB19335 ERS1892066 TRUE TRUE DNE FALSE main text 2 10.1371/journal.pone.0139705 TRUE MAMS 18955 AMS NR NR tooth 3574 19 -20.7 49 -99999 3.3 TRUE IntCal13 OxCal v4.2.24 default 10.1017/S0033822200033865 3957 3832 3873 cal BP 2 TRUE FALSE DNE NA NA NA NA Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT5 PRJEB24296 ERS2106903 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29430 NR NR NR tooth 3517 27 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3868 3704 3789 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT6 PRJEB24296 ERS2106904 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29431 NR NR NR tooth 3499 25 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3842 3696 -99999 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT003.B PRJEB29991 ERS3465379 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34551 . . . bone 1533 25 -31.2 . . . NA DNE DNE DNE . . 428 595 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT004 merged PRJEB29991 ERS3465380,ERS3465381 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI001.A PRJEB29991 ERS3465382 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 MAMS-38612 . . . bone 1497 24 -28.7 . . . NA DNE DNE DNE . . 474 637 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI003.A PRJEB29991 ERS3465383 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI004.A PRJEB29991 ERS3465384 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI005.A PRJEB29991 ERS3465385 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD001.A PRJEB29991 ERS3465386 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD002.A PRJEB29991 ERS3465387 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD007.A PRJEB29991 ERS3465388 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD013.A PRJEB29991 ERS3465389 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD019.A PRJEB29991 ERS3465390 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD020.A PRJEB29991 ERS3465391 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD021.A PRJEB29991 ERS3465392 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD022.A PRJEB29991 ERS3465393 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD023.A PRJEB29991 ERS3465394 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD024.A PRJEB29991 ERS3465395 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . NA DNE DNE DNE . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD026.A PRJEB29991 ERS3465396 FALSE NA . DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE . . DNE NA NA NA . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . NA NA NA DNE . DNE DNE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC001 merged PRJEB29991 ERS3465397,ERS3465398 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34561 . . . bone 1492 23 -13.1 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 539 632 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC005 merged PRJEB29991 ERS3465399,ERS3465400,ERS3465401 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34554 . . . bone 1505 24 -24.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 618 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC006.A PRJEB29991 ERS3465402 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34565 . . . bone 1505 24 -17.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 543 635 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET004.A PRJEB29991 ERS3465404 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31028 . . . bone 1517 17 -22.3 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 600 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET005.A PRJEB29991 ERS3465405 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31033 . . . bone 1487 21 -23.8 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 542 630 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET006.A PRJEB29991 ERS3465406 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31034 . . . bone 1551 20 -19.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 427 558 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT002.A PRJEB29991 ERS3465407 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31035 . . . bone 1555 20 -19 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 427 553 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT003.A PRJEB29991 ERS3465408 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31029 . . . bone 1520 17 -21.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 433 599 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT004.A PRJEB29991 ERS3465409 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31036 . . . bone 1587 20 -20.9 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 419 537 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT005.A PRJEB29991 ERS3465410 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-34558 . . . bone 1505 24 -24.6 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 434 618 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT006.A PRJEB29991 ERS3465411 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31037 . . . bone 1507 20 -22.7 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 437 611 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 VAL001.B PRJEB29991 ERS3465403 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-29429 . . . tooth 1512 22 -18.2 . . . TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 . . 432 610 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . -Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 WAG001.A PRJEB29991 ERS3465412 TRUE TRUE . FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS-31030 . . . bone 1547 16 -15.7 . . . TRUE IntCal13 CALIB NR . . 427 563 NA cal AD . TRUE FALSE . NA . . . +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT003.B PRJEB29991 ERS3465379 TRUE TRUE 1450-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34551 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1533 25 -31.2 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 428 595 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT004 merged PRJEB29991 ERS3465380,ERS3465381 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI001.A PRJEB29991 ERS3465382 TRUE TRUE 1450-1400BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 MAMS 38612 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1497 24 -28.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 474 637 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI003.A PRJEB29991 ERS3465383 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI004.A PRJEB29991 ERS3465384 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI005.A PRJEB29991 ERS3465385 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD001.A PRJEB29991 ERS3465386 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD002.A PRJEB29991 ERS3465387 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD007.A PRJEB29991 ERS3465388 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD013.A PRJEB29991 ERS3465389 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD019.A PRJEB29991 ERS3465390 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD020.A PRJEB29991 ERS3465391 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD021.A PRJEB29991 ERS3465392 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD022.A PRJEB29991 ERS3465393 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD023.A PRJEB29991 ERS3465394 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD024.A PRJEB29991 ERS3465395 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD026.A PRJEB29991 ERS3465396 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC001 merged PRJEB29991 ERS3465397,ERS3465398 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34561 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1492 23 -13.1 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 539 632 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC005 merged PRJEB29991 ERS3465399,ERS3465400,ERS3465401 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34554 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1485 24 -17.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 543 635 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC006.A PRJEB29991 ERS3465402 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34565 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1453 24 -25.1 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 567 648 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET004.A PRJEB29991 ERS3465404 TRUE TRUE 1380-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31028 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1517 17 -22.3 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 434 600 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET005.A PRJEB29991 ERS3465405 TRUE TRUE 1420-1220BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31033 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1487 21 -23.8 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 542 630 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET006.A PRJEB29991 ERS3465406 TRUE TRUE 1380-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31034 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1551 20 -19.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 558 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT002.A PRJEB29991 ERS3465407 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31035 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1555 20 -19 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 553 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT003.A PRJEB29991 ERS3465408 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31029 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1520 17 -21.9 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 433 599 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT004.A PRJEB29991 ERS3465409 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31036 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1587 20 -20.9 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 419 537 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT005.A PRJEB29991 ERS3465410 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34558 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1505 24 -24.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 434 618 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT006.A PRJEB29991 ERS3465411 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31037 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1507 20 -22.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 437 611 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 VAL001.B PRJEB29991 ERS3465403 TRUE TRUE 1450-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 29429 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) tooth 1512 22 -18.2 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 432 610 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA +Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 WAG001.A PRJEB29991 ERS3465412 TRUE TRUE 1450-1400BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31030 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1547 16 -15.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 CALIB 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 563 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA From f2357bbf9892e3190efdf81f2447f97a115b1d8c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: marcel-keller <61977721+marcel-keller@users.noreply.github.com> Date: Fri, 7 Feb 2025 15:02:46 +0100 Subject: [PATCH 3/3] Update CHANGELOG.md added Keller2019 --- CHANGELOG.md | 2 ++ 1 file changed, 2 insertions(+) diff --git a/CHANGELOG.md b/CHANGELOG.md index 0ed3be34f..5282019ac 100644 --- a/CHANGELOG.md +++ b/CHANGELOG.md @@ -13,6 +13,8 @@ and this project follows to [Calendar Versioning](https://calver.org/). #### Ancient Single Genome: Host Associated +- C14 Keller2019 10.1073/pnas.1820447116 (added by @marcel-keller) + #### Ancient Metagenome: Environmental ### Changed