Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

Sign up for GitHub

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

C14 Keller2019 #1362

Open
wants to merge 3 commits into
base: master
Choose a base branch
from
Open

C14 Keller2019 #1362

Show file tree
Hide file tree
Changes from all commits
Commits
Show all changes
3 commits
Select commit Hold shift + click to select a range
cc7fd6c
C14Keller2019
KaHea-21 Feb 7, 2025
53fe467
Update ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv
marcel-keller Feb 7, 2025
f2357bb
Update CHANGELOG.md
marcel-keller Feb 7, 2025
File filter

Filter by extension

Filter by extension
Conversations
Failed to load comments.
Loading
Jump to
Jump to file
Failed to load files.
Loading
Diff view
Diff view
2 changes: 2 additions & 0 deletions CHANGELOG.md
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -13,6 +13,8 @@ and this project follows to [Calendar Versioning](https://calver.org/).

#### Ancient Single Genome: Host Associated

- C14 Keller2019 10.1073/pnas.1820447116 (added by @marcel-keller)

#### Ancient Metagenome: Environmental

### Changed
Expand Down
30 changes: 30 additions & 0 deletions ancientsinglegenome-hostassociated/dates/ancientsinglegenome-hostassociated_dates.tsv
View file
Open in desktop
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -3,3 +3,33 @@ AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 1343UnTal85 PRJEB19335 ERS18
AndradesValtuena2017 2017 10.1016/j.cub.2017.10.025 6Post PRJEB19335 ERS1892066 TRUE TRUE DNE FALSE main text 2 10.1371/journal.pone.0139705 TRUE MAMS 18955 AMS NR NR tooth 3574 19 -20.7 49 -99999 3.3 TRUE IntCal13 OxCal v4.2.24 default 10.1017/S0033822200033865 3957 3832 3873 cal BP 2 TRUE FALSE DNE NA NA NA NA
Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT5 PRJEB24296 ERS2106903 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29430 NR NR NR tooth 3517 27 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3868 3704 3789 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA
Spyrou2018 2018 10.1038/s41467-018-04550-9 RT6 PRJEB24296 ERS2106904 TRUE TRUE DNE FALSE main text 1 10.1038/s41467-018-04550-9 TRUE MAMS 29431 NR NR NR tooth 3499 25 -99999 -99999 -99999 -99999 TRUE NR NR NR NR NR 3842 3696 -99999 cal BP 2 FALSE DNE DNE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT003.B PRJEB29991 ERS3465379 TRUE TRUE 1450-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34551 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1533 25 -31.2 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 428 595 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 DIT004 merged PRJEB29991 ERS3465380,ERS3465381 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI001.A PRJEB29991 ERS3465382 TRUE TRUE 1450-1400BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 MAMS 38612 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1497 24 -28.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 474 637 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI003.A PRJEB29991 ERS3465383 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI004.A PRJEB29991 ERS3465384 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 EDI005.A PRJEB29991 ERS3465385 FALSE NA 1450-1350BP DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD001.A PRJEB29991 ERS3465386 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD002.A PRJEB29991 ERS3465387 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD007.A PRJEB29991 ERS3465388 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD013.A PRJEB29991 ERS3465389 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD019.A PRJEB29991 ERS3465390 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD020.A PRJEB29991 ERS3465391 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD021.A PRJEB29991 ERS3465392 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD022.A PRJEB29991 ERS3465393 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD023.A PRJEB29991 ERS3465394 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD024.A PRJEB29991 ERS3465395 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LSD026.A PRJEB29991 ERS3465396 FALSE NA 1200-1150BP? DNE DNE DNE DNE DNE DNE . DNE DNE DNE DNE NA NA NA NA NA NA NA DNE DNE DNE DNE DNE NA NA NA DNE NA DNE DNE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC001 merged PRJEB29991 ERS3465397,ERS3465398 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34561 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1492 23 -13.1 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 539 632 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC005 merged PRJEB29991 ERS3465399,ERS3465400,ERS3465401 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34554 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1485 24 -17.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 543 635 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 LVC006.A PRJEB29991 ERS3465402 TRUE TRUE 1550-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34565 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1453 24 -25.1 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 567 648 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET004.A PRJEB29991 ERS3465404 TRUE TRUE 1380-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31028 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1517 17 -22.3 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 434 600 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET005.A PRJEB29991 ERS3465405 TRUE TRUE 1420-1220BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31033 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1487 21 -23.8 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 542 630 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 PET006.A PRJEB29991 ERS3465406 TRUE TRUE 1380-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31034 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1551 20 -19.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 558 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT002.A PRJEB29991 ERS3465407 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31035 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1555 20 -19 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 553 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT003.A PRJEB29991 ERS3465408 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31029 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1520 17 -21.9 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 433 599 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT004.A PRJEB29991 ERS3465409 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31036 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1587 20 -20.9 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 419 537 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT005.A PRJEB29991 ERS3465410 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 34558 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1505 24 -24.6 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 434 618 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 UNT006.A PRJEB29991 ERS3465411 TRUE TRUE 1400-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31037 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1507 20 -22.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 437 611 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 VAL001.B PRJEB29991 ERS3465403 TRUE TRUE 1450-1350BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 29429 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) tooth 1512 22 -18.2 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 OxCal 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 432 610 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA
Keller2019 2019 10.1073/pnas.1820447116 WAG001.A PRJEB29991 ERS3465412 TRUE TRUE 1450-1400BP FALSE supplement text 1 10.1073/pDNEs.1820447116 TRUE MAMS 31030 AMS FALSE Collagen (ultrafiltered) bone 1547 16 -15.7 -99999 -99999 -99999 TRUE IntCal13 CALIB 4.3.2 default 10.1017/S0033822200033865 427 563 NA cal AD 2 TRUE FALSE DE NA NA NA NA