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基因编辑效率分析 Bash 脚本

CRISPResso2 analysis of high-throughput sequencing data 该脚本用于复现Evaluation and minimization of Cas9-independent off-target DNA editing by cytosine base editors文章中fig.2c,使用CRISPResso2分析高通量测序数据,统计基因编辑效率。

功能

  • 分析原始数据
  • 计算编辑效率
  • 输出结果到指定文件夹

使用方法

  1. 克隆此仓库到本地:
    git clone https://github.com/kerui0928/editing-efficiency-analysis.git
    cd editing-efficiency-analysis